再エネの証書をとったのに間に合わないという最悪のパターンについては私も悩んだのでシェアさせていただきたいのですが、
・多少割高でも、即日証書が発行されるグリーン電力証書(GreenCartなど)を選ぶ。
私が知る限り、J-クレは割安ですが時間がかかります。
・補助金の受付は、申請書の到着順と考えられるため、電力証書を買わない状態で送ってしまう。(支払い前でも内容は書ける/到着受付を確認してから実際購入、証書送付する)
・郵送よりもメールのほうが受付が早い可能性
と考えていました。
受付順については、経産省の方の締め切りタイミングが申請書の到着日で区切られたことや、書類に不備、不足があってもある程度柔軟にやり取りがあった状況を見ての予想です。
正しいかどうか、推奨してよいものかどうかはわかりませんが、もし本当に微妙なタイミングになってしまった場合は、一つのアイデアとしてご参考ください。